2000 год. В Сан Жоан Деспи заложен первый камень спортивного комплекса "Сьюдад Депортива Жоан Гампер", где основная команда будет тренироваться начиная с 2009 года.
Сезон 2009-10 выдался не очень удачным для Рафы Маркеса. Он получал совсем немного игрового времени, а того, что получал, не хватило, чтобы убедить Пепа Гвардиолу в своей способности выходить в основе. Несмотря на это, клуб подписал с игроком новый контракт, рассчитанный на 2 сезона.
По окончанию сезона Маркес отправился вместе со сборной Мексики на Мундиаль, где показывает великолепную игру. Конечно же, начались слухи о его будущем, и одним из них стала заинтересованность бывшего тренера "Барселоны" Франка Райкаарда, который ныне тренирует "Галатасарай", в услугах мексиканского центрального защитника.
Но своим выступлением в сборной на не очень привычной позиции опорника Маркес показал, что вполне может остаться и в "Барсе". Но это не останавливает Райкаарда, который, по информации турецких газет, считает защитника своей приоритетной целью трансферного окна.